CReSCENT est une plateforme Web développée conjointement par l'équipe du Dr Trevor Pugh au Réseau universitaire de santé (UHN) et l'équipe du Dr Michael Brudno à The Hospital for Sick Children. Elle est conçue pour faciliter l'analyse et la visualisation des données de séquençage d'ARN sur cellule unique (scRNA-seq), en particulier dans la recherche sur le cancer. CReSCENT vise à rendre l'analyse avancée de cellules uniques accessible aux chercheurs, y compris ceux sans expertise informatique approfondie.

Principales caractéristiques :

• Interface conviviale : Fournit un portail Web intuitif permettant aux utilisateurs de réaliser des analyses standardisées de données scRNA-seq sans nécessiter d'installations complexes ni de commandes en ligne de texte.
• Pipelines préconfigurés : Intègre des pipelines conteneurisés basés sur la boîte à outils R Seurat, permettant aux utilisateurs de traiter et d'analyser les données scRNA-seq à l'aide de flux de travail normalisés. Ces pipelines sont modifiables par l'utilisateur, ce qui permet l'optimisation et la personnalisation selon les besoins expérimentaux spécifiques.
• Gestion des données publiques et privées : Utilise des ensembles de données publiques pour l'analyse comparative et l'étalonnage. Les utilisateurs peuvent également téléverser leurs propres données scRNA-seq, avec la possibilité de garder les résultats privés ou de les partager avec des collaborateurs, favorisant ainsi un cadre de recherche collaboratif.
• Évolutivité : Conçue sur une architecture évolutive capable de traiter des ensembles de données de tailles variées, des petites études pilotes aux projets d'envergure sur cellules uniques.

Disponibilité : CReSCENT est gratuit et accessible en ligne. La plateforme est mise à la disposition de la communauté de recherche pour encourager son adoption et stimuler la collaboration.

Remarque : Toutes les ressources et la documentation sont fournies en anglais.

En combinant des interfaces conviviales et des pipelines d'analyse robustes, CReSCENT permet aux chercheurs de réaliser des analyses approfondies sur cellules uniques, faisant ainsi progresser notre compréhension de la biologie du cancer à l'échelle cellulaire.