Ce dépôt de code R fournit des implémentations pour le modèle de capture-recapture de Cormack-Jolly-Seber (CJS), une méthode statistique fondamentale utilisée en écologie et en biologie de la faune pour estimer les probabilités de survie et la taille des populations à partir de données de capture-recapture . Le modèle CJS est particulièrement utile pour les populations ouvertes où les individus peuvent entrer (naissance, immigration) ou quitter (mort, émigration) la zone d'étude entre les périodes d'échantillonnage. Bien que le dépôt mentionne explicitement « mouse-recapture », la méthodologie sous-jacente du CJS s'applique largement à diverses populations animales. Les scripts sont développés en R, un environnement performant pour la modélisation statistique. Le modèle CJS repose sur l'analyse des historiques de rencontre d'individus marqués, généralement représentés sous la forme de séquences de captures (1) ou de non-captures (0) sur plusieurs périodes d'échantillonnage . Les capacités techniques de ces scripts comprennent la préparation des données pour l'analyse de capture-recapture, l'ajustement des modèles CJS, l'estimation de paramètres tels que la survie apparente et les probabilités de recapture, et potentiellement la sélection de modèles pour déterminer le modèle le mieux ajusté . Des packages R comme 'RMark' et 'marked' sont couramment utilisés pour l'analyse CJS, offrant des interfaces fondées sur des formules ainsi que des outils pour extraire et manipuler les données, générer des graphiques et faire des simulations . L'analyse peut traiter des données provenant de multiples sessions de capture-recapture et tenir compte des variations des taux de capture . Cette ressource numérique est hautement pertinente pour les écologistes, les gestionnaires de la faune et les biologistes de la conservation. Elle permet l'évaluation quantitative de la dynamique des populations, fournissant des renseignements essentiels sur les taux de survie et les tendances démographiques. Les applications incluent le suivi des espèces en péril, l'évaluation de l'impact des changements environnementaux sur les populations fauniques et l'orientation des stratégies de gestion pour une utilisation durable des ressources. Les avantages comprennent une inférence statistique robuste pour les paramètres de population, une souplesse dans la spécification des modèles et la capacité d'analyser des ensembles de données de capture-recapture complexes. Le code est compatible avec les installations standard de R et est conçu pour fonctionner avec les formats de données de capture-recapture usuels.