Le Cy5.5 est un fluorophore proche infrarouge avec une Ex/Em de 680/710 nm, couramment utilisé pour le marquage des protéines, des acides nucléiques et des cellules dans diverses applications d'imagerie et de détection. Il est offert sous forme de solution mère à 5 mg/mL dans du PBS (5.45 mM) et peut être utilisé pour le marquage des protéines, par ex. 8 µL pour 500 µL d'IgG à 2 mg/mL (PM=150 000).