Traduit de l'anglais
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La plateforme 10x Genomics Visium HD (Cytassist) offre une transcriptomique spatiale haute définition, permettant l'analyse du transcriptome entier à l'échelle de la cellule unique. Elle combine l'histologie et le profilage d'expression génique spatialement résolu, facilitant la localisation détaillée et la quantification de l'expression des gènes dans le contexte tissulaire. Visium HD utilise une architecture de lame repensée comportant des millions de carrés avec code-barres de 2x2 µm, assurant une couverture tissulaire continue sans lacunes, une amélioration majeure par rapport aux versions précédentes. Cette conception facilite la cartographie à haute résolution de coupes entières de tissus, idéale pour les études nécessitant des données spatiales précises en cancérologie, en neurosciences et en biologie du développement. L'appareil Cytassist simplifie le flux de travail en permettant le transfert de sondes transcriptomiques depuis des lames de verre standards (incluant les tissus FFPE ou congelés à l'état frais colorés à l'H&E ou par immunofluorescence) vers les lames Visium HD, élargissant la compatibilité des échantillons. Il s'agit d'une méthode basée sur des sondes ciblant l'ensemble du transcriptome d'ARNm.
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