Ressource numériqueDisponible
GenPipes : Cadre de pipelines flexible basé sur Python
Traduit de l'anglais
Devis sur demande
Faculty of Medicine and Health Sciences
Core Facility
McGill University
GenPipes est un cadre logiciel à code source ouvert basé sur Python, conçu pour faciliter le développement et le déploiement de flux de travail à étapes multiples optimisés pour les grappes HPC et les environnements infonuagiques. Il propose 12 pipelines validés et évolutifs pour diverses applications de génomique, notamment RNA-Seq, le séquençage du génome entier (WGS), le séquençage de l'exome entier (WES), ChIP-Seq et Hi-C.
- Disponibilité : Gratuit et à code source ouvert
- Licence : Licence libre LGPL genpipes.readthedocs.io
Pour consulter la documentation détaillée et les tutoriels, reportez-vous aux ressources suivantes :
Remarque : La documentation d'appui est disponible en anglais seulement.
Le C3G demeure déterminé à maintenir et à mettre à jour ces outils afin de suivre les dernières avancées en génomique et en bio-informatique, garantissant ainsi aux chercheurs l'accès à des ressources de pointe pour leurs travaux scientifiques.
Canadian Centre for Computational Genomics (C3G)
Faculty of Medicine and Health Sciences
Plateforme de recherche partagée qui offre des instruments, des services et une expertise.
GB
Guillaume Bourque
Canadian Centre for Computational Genomics (C3G) · McGill UniversityRessource numériqueDisponible
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