La méthylation de l'ADN joue un rôle crucial dans la régulation épigénétique, en influençant l'expression génique, la stabilité génomique et la différenciation cellulaire. Le pipeline Methyl-Seq du C3G offre une analyse complète des changements de méthylation de l'ADN à une résolution d'une seule base, apportant un éclairage sur le profil épigénomique dans différentes conditions.

Grâce à Bismark, le C3G aligne les lectures de séquençage sur un génome de référence converti au bisulfite, évaluant avec précision les niveaux de méthylation à chaque site CpG. L'analyse de méthylation différentielle est réalisée à l'aide de modèles linéaires simples ou complexes, permettant aux chercheurs d'identifier les changements significatifs dans les profils de méthylation entre les conditions expérimentales.

Le pipeline Methyl-Seq du C3G est également optimisé pour :

• Le séquençage au bisulfite à représentation réduite (RRBS), une méthode économique pour analyser les régions génomiques riches en CpG.
• Le séquençage ciblé au bisulfite avec le système SeqCap Epi, permettant un profilage de méthylation à haute couverture de régions génomiques spécifiques.

En intégrant l'analyse de la méthylation à d'autres données épigénomiques et transcriptomiques, les services Methyl-Seq du C3G constituent un outil puissant pour comprendre le rôle de la méthylation de l'ADN dans la régulation génique, le développement et la progression des maladies.