STAGER est une application Web à code source ouvert conçue pour faciliter le partage, le suivi et l'analyse de jeux de données génomiques et exomiques, en particulier dans le cadre du projet Care4Rare - une initiative pancanadienne visant à améliorer le diagnostic et le traitement des maladies rares. STAGER permet aux chercheurs de gérer et d'analyser efficacement des données génomiques et autres données omiques à grande échelle.

Principales fonctionnalités :

• Gestion des métadonnées : permet aux utilisateurs de saisir et de modifier des métadonnées génomiques, en les liant aux jeux de données pertinents pour une organisation simplifiée des données.
• Téléversement et intégration des données : prend en charge le téléversement des fichiers de jeux de données et les associe aux métadonnées correspondantes pour assurer une gestion cohérente des données.
• Demandes d'analyses automatisées : permet aux utilisateurs de demander des analyses précises au moyen de pipelines automatisés, de suivre leur état et d'obtenir des rapports agrégés sur les variants génomiques détectés.
• Plateforme collaborative : conçue pour soutenir la collaboration entre chercheurs, facilitant le partage de données et les démarches d'analyse collectives.

Disponibilité : STAGER est gratuit et à code source ouvert, distribué sous la licence MIT. Les chercheurs et les établissements peuvent y accéder, le déployer et contribuer à son développement par l'intermédiaire du dépôt GitHub.

Remarque : Toutes les ressources et la documentation sont fournies en anglais.

En offrant une suite complète d'outils pour la gestion et l'analyse des données, STAGER renforce les capacités des chercheurs travaillant sur les maladies rares, favorisant ainsi un traitement efficace des données et les découvertes scientifiques collaboratives.